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CRISPR 產(chǎn)品和服務(wù)
CRISPR-Cas9 是一種用于基因組編輯的工具,已從細(xì)菌的先天免疫反應(yīng)中改編而來。細(xì)菌捕獲并存儲(chǔ)來自入侵病毒或 DNA 的 DNA 片段,該區(qū)域稱為 CRISPR(成簇規(guī)則間隔短回文重復(fù)序列)陣列。該區(qū)域不斷轉(zhuǎn)錄,產(chǎn)生短的 CRISPR RNA (crRNA) 引導(dǎo)序列,當(dāng)它們檢測(cè)到入侵病毒或與其互補(bǔ)的 DNA 時(shí),結(jié)合并招募 Cas9(CRISPR 相關(guān)蛋白 9)核酸酶,然后特異性切割入侵的DNA。這導(dǎo)致入侵的DNA降解,從而保護(hù)細(xì)胞。
該 CRISPR-Cas9 系統(tǒng)也經(jīng)過修改,可用于哺乳動(dòng)物細(xì)胞。通過在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中表達(dá) Cas9 核酸酶并引入對(duì)我們感興趣的基因特異的單一引導(dǎo) RNA 序列 (sgRNA),我們可以將雙鏈斷裂引入細(xì)胞的基因組 DNA,以敲除或修改感興趣的基因。
CRISPR 基因敲除
Cas9(化膿性鏈球菌CRISPR 相關(guān)蛋白 9)是一種核酸內(nèi)切酶,當(dāng)被 sgRNA(單向?qū)?span> RNA)募集到特定 DNA 序列時(shí),會(huì)在 DNA 中引入雙鏈斷裂。這種雙鏈斷裂最常在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中通過非同源末端連接 (NHEJ) 進(jìn)行修復(fù)。
NHEJ 通常會(huì)導(dǎo)致切割位點(diǎn)的幾個(gè)堿基對(duì)的缺失或插入,當(dāng)導(dǎo)致移碼時(shí),會(huì)導(dǎo)致目標(biāo)基因的功能失活或敲除。為了敲除您感興趣的基因,BPS Biosciences 提供以下解決方案:
整合 sgRNA 和 Cas9 敲除慢病毒
我們的 Cas9 慢病毒是無法復(fù)制的、基于 HIV 的 VSV-G 假型慢病毒顆粒,可隨時(shí)轉(zhuǎn)導(dǎo)到幾乎所有類型的哺乳動(dòng)物細(xì)胞中,包括原代和非分裂細(xì)胞。這些顆粒包含一個(gè)由 EF1a 啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)的 CRISPR/Cas9 基因,以及由 U6 啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)的 4 個(gè)經(jīng)驗(yàn)證的 sgRNA(單向?qū)?span> RNA),靶向您感興趣的基因。
我們的慢病毒到達(dá)時(shí)可直接轉(zhuǎn)導(dǎo)——不需要其他組件——我們整合 sgRNA 和 Cas9 慢病毒是快速生成敲除細(xì)胞系或細(xì)胞庫(kù)的可靠方法;基因敲除效率可高達(dá) 90%,具體取決于基因和細(xì)胞類型。
非整合 sgRNA 和 Cas9 敲除慢病毒
與我們的整合 sgRNA 和 Cas9 慢病毒不同,我們的非整合慢病毒由突變的整合酶制成,導(dǎo)致 sgRNA 和 Cas9 在您的目標(biāo)細(xì)胞中僅瞬時(shí)表達(dá)。盡管與我們的整合慢病毒相比,這可能會(huì)導(dǎo)致較低的敲除效果(取決于您的基因和細(xì)胞類型),但非整合慢病毒消除了慢病毒隨機(jī)整合到生理相關(guān)基因中的風(fēng)險(xiǎn),并最大限度地減少了任何潛在的關(guān)閉如果 Cas9 穩(wěn)定表達(dá),可能會(huì)發(fā)生靶向。我們所有的慢病毒都經(jīng)過驗(yàn)證并可以直接轉(zhuǎn)導(dǎo)。
Cas9 表達(dá)細(xì)胞池
這些細(xì)胞庫(kù)已經(jīng)組成型表達(dá) Cas9。要敲除您感興趣的基因,您只需通過電穿孔或慢病毒轉(zhuǎn)導(dǎo)傳遞您的基因特異性 sgRNA。這些價(jià)格實(shí)惠,可以成為設(shè)置您自己的敲除實(shí)驗(yàn)或篩選的經(jīng)濟(jì)高效的平臺(tái)。
Cas9蛋白
我們的 Cas9 蛋白可用于體外切割分析,以比較和鑒定具有最高切割效率的 sgRNA。
定制淘汰賽服務(wù)
借助 BPS Bioscience 的定制細(xì)胞系開發(fā)服務(wù),我們經(jīng)驗(yàn)豐富的科學(xué)家團(tuán)隊(duì)可以使用 CRISPR-Cas9 許可技術(shù)在 70 多種不同細(xì)胞類型中生成定制的敲除細(xì)胞系,針對(duì)您感興趣的任何基因. 開發(fā)過程由單獨(dú)的里程碑組成,其中在每個(gè)里程碑完成后提供數(shù)據(jù)。通過直接與您合作,每個(gè)項(xiàng)目都是針對(duì)所需的可交付成果進(jìn)行定制的。聯(lián)系我們以詳細(xì)了解我們可以提供的服務(wù)。
CRISPR 敲入
當(dāng) Cas9 在細(xì)胞的基因組 DNA 中產(chǎn)生雙鏈斷裂時(shí),哺乳動(dòng)物細(xì)胞會(huì)通過非同源末端連接 (NHEJ) 或同源定向修復(fù) (HDR) 進(jìn)行修復(fù)。當(dāng)細(xì)胞經(jīng)歷 HDR 時(shí),我們可以提供替代模板,ssDNA 寡核苷酸或質(zhì)粒供體,其中包含我們想要引入的基因突變(突變或標(biāo)簽),兩側(cè)是同源臂,細(xì)胞將使用它作為模板將這些變化復(fù)制并整合到基因組 DNA 中。
定制敲入服務(wù)
借助 BPS Bioscience 的定制細(xì)胞系開發(fā)服務(wù),我們經(jīng)驗(yàn)豐富的科學(xué)家團(tuán)隊(duì)可以使用 CRISPR-Cas9 許可技術(shù)在 70 多種不同細(xì)胞類型中生成定制的敲入細(xì)胞系,針對(duì)您感興趣的任何基因. 開發(fā)過程由單獨(dú)的里程碑組成,其中在每個(gè)里程碑完成后提供數(shù)據(jù)。通過直接與您合作,每個(gè)項(xiàng)目都是針對(duì)所需的可交付成果進(jìn)行定制的。聯(lián)系我們以詳細(xì)了解我們可以提供的服務(wù)。
CRISPR激活
CRISPR 協(xié)同激活介質(zhì) (SAM) 系統(tǒng)用于誘導(dǎo)任何感興趣基因的轉(zhuǎn)錄激活和表達(dá)。SAM 系統(tǒng)由 3 個(gè)組件組成:(1) 突變的 dCas9(化膿性鏈球菌CRISPR 相關(guān)蛋白 9),缺乏任何核酸內(nèi)切酶活性,與轉(zhuǎn)錄激活因子 VP64 融合;(2) P65(轉(zhuǎn)錄因子p65,或核因子NF-κ-B p65)和HSF1(熱激因子1)與MS2標(biāo)簽融合;(3) 帶有 MS2 標(biāo)簽的 sgRNA,靶向目標(biāo)基因的啟動(dòng)子區(qū)域。
一旦 sgRNA-MS2 靶向感興趣基因的啟動(dòng)子區(qū)域,dCas9-VP64 和 MS2-P65-HSF1 就會(huì)被募集到基因組 DNA 中的位點(diǎn)并開始轉(zhuǎn)錄,從而誘導(dǎo)所需基因的表達(dá)。誘導(dǎo)可以超過一百倍,這取決于基因。
為了利用 SAM 系統(tǒng)誘導(dǎo)您感興趣的基因表達(dá),BPS Biosciences 提供以下解決方案:
CRISPR 激活 (CRISPRa) 細(xì)胞系
除 sgRNA-MS2 外,這些細(xì)胞系穩(wěn)定表達(dá)激活您感興趣的基因所需的所有成分。這些細(xì)胞表達(dá)突變的 dCas9(缺乏任何核酸內(nèi)切酶活性)與 VP64、轉(zhuǎn)錄激活因子、P65(轉(zhuǎn)錄因子 p65,或核因子 NF-κ-B p65)和 HSF1(熱休克因子 1)與 MS2 標(biāo)簽融合.
當(dāng)這些細(xì)胞用 MS2 標(biāo)記的 sgRNA 轉(zhuǎn)導(dǎo)到您感興趣的基因的啟動(dòng)子區(qū)域時(shí),dCas9-VP64 和 MS2-P65-HSF1 被募集到基因組 DNA 中的位點(diǎn)并開始轉(zhuǎn)錄,誘導(dǎo)您所需基因的表達(dá). 基因特異性 sgRNA-MS2 可以通過慢病毒轉(zhuǎn)導(dǎo)或電穿孔傳遞。這些細(xì)胞系可以成為一個(gè)方便且經(jīng)濟(jì)高效的平臺(tái),用于設(shè)置您自己的激活實(shí)驗(yàn)或篩選,而無需首先選擇表達(dá) dCas9-VP64 和 MS2-P65-HSF1 的單細(xì)胞克隆,從而節(jié)省寶貴的時(shí)間。
整合 dCas9-VP64 和 MS2-P65-HSF1 慢病毒
我們的 Cas9 慢病毒是無法復(fù)制的、基于 HIV 的 VSV-G 假型慢病毒顆粒,可隨時(shí)轉(zhuǎn)導(dǎo)到幾乎所有類型的哺乳動(dòng)物細(xì)胞中,包括原代細(xì)胞和非分裂細(xì)胞。這些顆粒包含 dCas9-VP64(具有殺稻瘟素抗性)和 MS2-P65-HSF1(具有潮霉素抗性)基因,可與 sgRNA-MS2 激活慢病毒結(jié)合使用,以生成您自己的 CRISPR 激活 (CRISPRa) 細(xì)胞系.
整合 sgRNA-MS2 激活慢病毒
這些慢病毒顆粒包含 4 個(gè)經(jīng)過驗(yàn)證的 sgRNA(單向?qū)?span> RNA),靶向目標(biāo)基因的啟動(dòng)子區(qū)域,與 MS2 融合并由 U6 啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)。這些慢病毒到達(dá)時(shí)可直接轉(zhuǎn)導(dǎo)到您的 dCas9-VP64 和 P65-HSF1-MS2 表達(dá)細(xì)胞系中,以穩(wěn)定激活您感興趣的基因的表達(dá)。
sgRNA-MS2 激活質(zhì)粒
雖然 Integrating sgRNA-MS2 慢病毒可用于生成穩(wěn)定誘導(dǎo)感興趣基因表達(dá)的細(xì)胞庫(kù)或細(xì)胞系,但 sgRNA-MS2 質(zhì)??梢赞D(zhuǎn)染或電穿孔到您的細(xì)胞中以進(jìn)行瞬時(shí)或穩(wěn)定(在藥物選擇后)激活。這還為您提供了無病毒選項(xiàng),具體取決于您的實(shí)驗(yàn)室環(huán)境或偏好。
自定義 CRISPR 激活 (CRISPRa) 服務(wù)
借助 BPS Bioscience 的定制細(xì)胞系開發(fā)服務(wù),我們經(jīng)驗(yàn)豐富的科學(xué)家團(tuán)隊(duì)可以使用 CRISPR-Cas9 許可技術(shù)在 70 多種不同細(xì)胞類型中生成定制的 CRISPR 激活細(xì)胞系,針對(duì)您感興趣的任何基因。開發(fā)過程由單獨(dú)的里程碑組成,其中在每個(gè)里程碑完成后提供數(shù)據(jù)。通過直接與您合作,每個(gè)項(xiàng)目都是針對(duì)所需的可交付成果進(jìn)行定制的。聯(lián)系我們以詳細(xì)了解我們可以提供的服務(wù)。
CRISPR 屏幕
CRISPR 激酶敲除文庫(kù)、陣列或池(即將推出?。?/p>
BPS Bioscience 正在構(gòu)建一個(gè)針對(duì)人類激酶的 CRISPR 敲除文庫(kù),可提供陣列和混合格式。我們的整合慢病毒可直接轉(zhuǎn)導(dǎo)到幾乎所有類型的哺乳動(dòng)物細(xì)胞中,包括原代細(xì)胞和非分裂細(xì)胞。除了適當(dāng)?shù)目刂仆?,每種格式還包括每個(gè)基因 4 個(gè) sgRNA。我們的陣列形式隨時(shí)可用,以每孔一個(gè)基因的形式提供,無需任何高通量篩選平臺(tái)或生物信息學(xué)分析。我們的混合形式以高滴度提供,并提供更便宜的替代方案,具體取決于您的篩選能力。
定制服務(wù)
借助 BPS Bioscience 的定制細(xì)胞系開發(fā)服務(wù),我們經(jīng)驗(yàn)豐富的科學(xué)家團(tuán)隊(duì)可以使用 CRISPR-Cas9 許可技術(shù)生成 CRISPR 文庫(kù),針對(duì)您感興趣的任何感興趣的基因。開發(fā)過程由單獨(dú)的里程碑組成,其中數(shù)據(jù)在每個(gè)里程碑完成后提供。通過直接與您合作,每個(gè)項(xiàng)目都是針對(duì)所需的可交付成果進(jìn)行定制的。聯(lián)系我們以詳細(xì)了解我們可以提供的服務(wù)。
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